時代背景
U．C．0088年2月22日，在地球圈發生了三股軍事力量的大決戰，其最終結果是提坦斯全軍覆沒，來自阿克西斯的新吉翁勢力大傷元氣，奧古取得了決定性的勝利。然而，動亂並未因此而結束。
2月24日，提坦斯一部分殘存的勢力組成以青年將校為核心的武裝，以“新迪賽斯”(簡稱ND)之名發動叛亂。
3月23日，聯邦軍編成以計伐ND為任務的前衛艦隊“阿爾法隊”——a隊。
3月28日，所羅門宙域的埃諾艦隊反叛，與ND合成合流，其後數天攻擊月面都市艾亞茲，至4月2日，月面守衛隊及其所配置的試驗型高達FAZZ被全滅。
4月5日，a隊對ND發動特攻，完成任務，提坦斯之亂終結。
然而，不安定因素仍然存在，駐紮在小行行阿克西斯的哈曼·卡恩，此時正悄悄積蓄實力，準備向地球聯邦及其部下發動進攻。這場將要發生的動亂，史上稱為第一次新吉恩戰爭，亦即哈曼之亂。
STORY
0088年6月6日，新吉恩軍向地球空降先遣部隊，經兩個月時間的活動，於8月1日正式發動對地救進攻。8月29日，新吉恩佔領達卡爾，並將大量舊公國軍及提坦斯殘黨收編。此後一發不可收拾，10月31日，新吉恩實施衛星墜落戰術，終於迫使聯邦於11月24日同意將殖民衛星群SIDE3讓給新吉恩，以此作為吉恩從地球撤兵的條件。
然而，哈曼的文治武略無法令所有追隨者認同。新吉恩旗下的年輕軍官格雷米，在“獨自振興吉恩”信念驅使下於聖誕節反叛哈曼，率部從阿克西斯獨立出來。
在這一系列重大變動造成的複雜局面中，代表聯邦而戰的軍事組織奧古，在以布萊德為首的領導層指揮下，持續著艱苦卓絕的鬥爭。成為這—一時期奧古主力的戰士，是以名叫捷多·五西塔的少年為首的一群來自殖民衛星的孩子，而捷多的座機，正是當年阿納海姆社以卡繆為中心所進行開發的“Z”計劃最後的作品——可變型機動戰士MSZ——010“高達ZZ”捷多的戀人露·魯卡則搭乘Z高達，其餘同伴亦分別乘坐高達MK-II等機種。
與阿姆羅、卡繆一樣，捷多也是一樣強大的NEWTYPE，然而似乎也正因如此，同樣難逃悲劇口口件的圍繞：在戰場上接觸到的新吉恩NEWTYPE少女璞露，以及璞露的克隆體璞露2(讀作“璞露茨”)，與捷多產生共鳴並消除敵意，但卻又隨之先後為保護捷多而喪生……
在露的激勵下，捷多終於從沮喪中擺脫出來，同時，露亦創下擊斃新吉恩叛軍首領格雷米的戰績。終於，在O089年1月17日，以奧古為核心的聯邦軍，向阿克西斯發動了最後的進攻。
戰鬥如火如荼地展開了，為各自所相信的理想，信念而爭個不休，同時進行著對決的捷多與哈曼，在一輪惡鬥後，以哈曼·卡恩之死迎來了這場動亂的結束。
隨著和平的曙光再次降臨，捷多與露一起踏上了前往木星的旅途。對他們而言，出生入死的人生經歷已經結束，新的生活正在前方招手。然而對於宇宙間多數平民百姓，真正的和平什麼時候才能來到呢?