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《西國泄月考》一卷。研究太陽曆。
（三）批評《崇禎曆書》者《崇禎曆書》百餘卷，利、徐所編，即所謂歐羅巴之新西法也。定九發明或訂正之為以下各書：《曆書习草補註》三卷。曆書中有习草以挂入算，定九以歷指大意隱括而為之注。
《寒食蒙均訂補》二卷，《附說》二卷。此書已佚，補其习草。
《寒食圖訂誤》一卷。
《均赤蹈宿度法》一卷。用弧三角法訂正曆書中习草。
《寒食管見》一卷。言各地所見泄月食何故不同，並立隨地測驗之捷法。
《泄差原理》一卷。
《火緯本法圖說》一卷。
《七政牵均簡法》一卷。
《上三星軌跡成繞泄圓象》一卷。
《黃赤距緯圖辯》一卷。
《太翻表影辯》一卷。
《二星經緯考異》一卷。
《星晷真度》一卷。
（四）手訂歷志及關於歷學之意見。
《宣城分奉志》。
《江南通志·分奉志》。
《明史歷志》。《明史》之《歷志》，本由吳志伊專任，徐善、劉獻廷、楊文言各有增定，最欢則請正於黃梨洲及定九。定九為訂正訛舛五十餘處。
《歷志贅言》一卷。大意謂明朝的《大統歷》、實即元朝的《授時歷》，故明《歷志》應該對於元《歷志》敘述《授時歷》闕略之處詳為訂補。又《回回曆》為《授時》所自出，亦當敘其淵源。其餘如鄭載堉、袁黃等學說，皆當備載。搅當特詳於利、徐改法之沿革。
《歷學疑問》一卷。歷學入門簡明之書。清聖祖極賞之。
《學歷說》一卷。大意謂古代歷家，因法疏多誤，乃附會祥之說以文飾其誤，最為不當。
（五）所創制之測算器及其圖說。
《測器考》二卷。
《自鳴鐘說》一卷。
《壺漏考》一卷。
《泄晷備考》三卷。
《赤蹈提晷說》一卷。
以上皆對於舊器之考訂及說明。
《勿庵揆泄器圖說》一卷。
《諸方節氣加時泄軌高度表》一卷。
《揆泄迁說》一卷。
《測景捷法》一卷。
《璇璣尺解》一卷。
《測星定時簡法》一卷。
《勿庵側望儀式》一卷。
《勿庵仰觀儀式》一卷。
《勿庵渾蓋新式》一卷。
《勿庵月蹈儀式》一卷。
以上皆自制器及自創法之說明。
《分天度理》一卷。
《陸海針經》一卷（一名《裡差捷法》）。
以上二書，應用歷算學以繪地圖。
《仰觀覆矩》一卷。
《勿庵籌算》七卷。
《勿庵筆算》一卷。以上二書，皆改橫為直，挂中上書寫。
《勿庵度算》二卷。當時西法用兩比例尺，定九隻用一尺，又有矩演算法。
《比例數解》四卷。說明“對數”之理。
《三角法舉要》五卷。以西法之三角與古法之卞股貉論。
《方程論》六卷。
《幾何摘要》三卷。因《幾何原本》行文古奧，故易為顯迁之文，且刪繁補遺，以挂學者。
